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隨著1月8日起我國(guó)對(duì)新型冠狀病毒實(shí)施“乙類(lèi)乙管”，國(guó)內(nèi)的新冠疫情防控進(jìn)入了新階段，抗疫工作的重心也從“防感染”轉(zhuǎn)到“保健康、防重癥”。對(duì)于各級(jí)政府來(lái)講，穩(wěn)妥有序?qū)嵤耙翌?lèi)乙管”是一項(xiàng)復(fù)雜的系統(tǒng)工程，面臨著新形勢(shì)和新任務(wù)。

在這一背景下，國(guó)家疾控部門(mén)進(jìn)一步完善新冠病毒變異監(jiān)測(cè)的工作方案，確保人民群眾的健康安全，在本土案例監(jiān)測(cè)方面，每個(gè)省份都選擇了部分的城市和醫(yī)院作為監(jiān)測(cè)哨點(diǎn)，對(duì)門(mén)診病歷、重癥和死亡病例開(kāi)展一定數(shù)量的新冠病毒感染病例的采樣和序列測(cè)定。

廣州醫(yī)科大學(xué)附屬市八醫(yī)院(以下簡(jiǎn)稱(chēng)廣州市八醫(yī)院)作為“入境患者定點(diǎn)收治醫(yī)院”，一直動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)新冠病毒變異的趨勢(shì)，以便能夠及時(shí)動(dòng)態(tài)掌握人群感染發(fā)病水平和變化趨勢(shì)，科學(xué)研判和預(yù)測(cè)疫情規(guī)模、強(qiáng)度和流行時(shí)間，動(dòng)態(tài)分析病毒株變異情況。

近日，廣州市八醫(yī)院基于華大智造的MGISEQ-2000基因測(cè)序儀、ATOPlex RNA多重PCR建庫(kù)試劑盒套裝V3.1以及MetargetCOVID軟件的測(cè)序組合，在收治的境外輸入新冠病毒感染者中檢測(cè)出了BQ.1.25、XBB.1、XBB.2等奧密克戎亞型變異毒株。

測(cè)序報(bào)告顯示測(cè)出BQ.1.25、XBB.1及XBB.2等變異毒株

據(jù)悉，華大智造MGISEQ-2000是一款靈活高效的測(cè)序平臺(tái)，搭配2種通量的載片：大載片(FCL)和小載片(FCS)，可獨(dú)立上機(jī)，單次運(yùn)行數(shù)據(jù)產(chǎn)量可從55Gb到1,440Gb；ATOPlex RNA多重PCR建庫(kù)試劑盒套裝V3.1則采用328對(duì)混合引物(平均擴(kuò)增178bp)來(lái)捕獲新冠病毒全基因組序列信息，對(duì)于低濃度、易降解的樣本友好、具有極高的靈敏度。再配合支持批量樣本快速分析MGI MetargetCOVID軟件，可實(shí)現(xiàn)對(duì)新冠病毒的準(zhǔn)確分型。

通過(guò)華大智造MGISEQ-2000、ATOPlexV3.1及MetargetCOVID軟件的測(cè)序組合，廣州市八醫(yī)院能夠單次完成96*個(gè)新冠樣本的測(cè)序工作，得到病毒序列全長(zhǎng)覆蓋率達(dá)到99%以上，測(cè)序效率高，測(cè)序結(jié)果質(zhì)量?jī)?yōu)異。

事實(shí)上，早在2021年5月，華大智造就為廣州市八醫(yī)院提供新冠病毒測(cè)序工作提供工具支撐。僅在2021年5月21日至2021年6月18日不到1個(gè)月的時(shí)間里，該院就確診出159例新冠Delta毒株病例。依托華大智造的ATOPlex技術(shù)平臺(tái)和MGISEQ-2000測(cè)序儀的測(cè)序組合產(chǎn)品，廣州市八醫(yī)院聯(lián)合廣州醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院等單位成功實(shí)現(xiàn)對(duì)新冠Delta病毒全基因組的測(cè)序、比對(duì)、分型和溯源。

“華大智造提供的國(guó)產(chǎn)高通量測(cè)序工具組合準(zhǔn)確、高效、操作簡(jiǎn)便，為新冠病毒變異監(jiān)測(cè)提供了強(qiáng)大的技術(shù)支撐。”廣州醫(yī)科大學(xué)附屬市八醫(yī)院傳染病研究所主任李鋒對(duì)于華大智造的測(cè)序工具組合表示了肯定。

作為國(guó)產(chǎn)測(cè)序儀龍頭，華大智造致力于成為“生命科技核心工具締造者”，其掌握的高通量測(cè)序技術(shù)在病原的監(jiān)測(cè)和溯源以及公共衛(wèi)生事件的應(yīng)對(duì)中發(fā)揮著極其重要的作用。后續(xù)針對(duì)醫(yī)療機(jī)構(gòu)、公共衛(wèi)生機(jī)構(gòu)開(kāi)展新型冠狀病毒感染疫情監(jiān)測(cè)的需求，華大智造實(shí)時(shí)、全景、全生命周期的測(cè)序產(chǎn)品組合，將持續(xù)助力病毒變異監(jiān)測(cè)工作，為新階段下的防控工作貢獻(xiàn)一份力量。

關(guān)鍵詞： 市八醫(yī)院